盡管濁度儀已覆蓋到水質監測中的方方面面，但實際應用中會受到各種因素的影響，如在采集總磷樣品時，需要根據現場水體的濁度值來決定總磷采樣前的處理方式。此外在線監測中，監測數據表明總磷的值在濁度達到100NTU后，濁度與誤差呈正相關性，即水樣濁度越大誤差越大，監測數據會比實際值偏大。在高濁度的情況下，濁度儀的監測數據與手工監測數據的可比性降低。因此濁度儀測量結果受到很多因素的影響，在使用濁度儀的過程中一定要注意規避這些問題，才能保證濁度參數的準確性。
1）散射光的角度。濁度儀檢測濁度的過程，就是確定懸浮顆粒在液體介質中的散射光率。而散射取決于粒子的濃度高低和粒子的散光效果。其次粒子的形狀和大小：顆粒小于1/10波長的可見光，散射光對稱，而較大的顆粒（通常直徑大于可見光的波長）光散射不對稱，所以測量濁度時散射的角度必須考慮。
2）入射光的波長。散射光的強度依賴于粒子的大小,以及液體顏色是否會減少光量，這樣也會對濁度的參數產生影響。總磷檢測的紫外波長為700nm，這些造成濁度的懸浮顆粒物會對此波長的光強有一定程度的吸收，且吸收會隨著濁度的增大而增大，進而對監測結果產生較大的影響。
3）水中物質對光的吸收。在進行濁度測量時，可以參照一個大致的波長檢測范圍，水體中存在的一些吸光物質或者是一些熒光會對濁度測量結果產生影響，但這種影響在操作時可以通過選擇比可見光波長更短的光線（比如<860nm近紅外）來達到干擾最小化的效果。
4）水體中流動的氣泡。在線監測水質濁度時，由于采用光學測量的方式，當水體流動時，氣泡會對測量結果產生干擾，數據波動很大。現有的消泡技術仍不成熟，取樣室的水壓不穩定，容易導致誤操作。對于這種情況可以選擇一個合適的安裝點來降低氣泡的干擾。
5）光學器件的表面污染。光學器件是濁度儀的主要構成部分，由于測量窗口與水樣長期接觸，在污水監測環境下，水體中的懸浮物可能會附著在光學器件表面，如油污類粘性雜質無法徹底去除，會降低透光效果，從而影響檢測結果和濁度儀的使用壽命，具有一定的局限性。
針對上述影響濁度儀監測精度的因素，可以從以下幾個方面改進：
1）除了在90°方向進行監測外，通過雙光束多路測量，可以實現自動補償，有效消除干擾；
2）避開總磷檢測區間波長，在水體有顏色、濁度高的情況下，選擇830~890nm波長的光束，而在低濁度下（≤10NTU），選擇波長為400~600nm的入射光；
3）在濁度儀設計時，加上一個消泡器，可以避免氣泡對水壓產生影響，保證測量值穩定；
4）光學器具可以在表面貼上一層防玷污的膜，另外加強超聲清洗器對濁度儀玻璃測量窗口的清洗，同時增加頻率和清潔時長，就能降低因為水質污染帶來的偏差。
